蚌埠医学院创建于1958年7月，由原上海第二医学院分迁和安徽医学院援建而成，是安徽省省属普通高等医学本科院校和国家首批具有学士和硕士学位授予权的单位，是安徽省院士工作站和博士后岗位设置单位，是国家第一批卓越医生教育培养计划试点高校、国家级大学生创新创业实践基地和校外实践基地，是教育部临床医学“5+3”改革试点高校、医学检验技术专业综合改革试点高校和临床技能综合培训中心。

学校占地面积近1000亩，总建筑面积达33万平方米。新校位于蚌埠市风景秀丽的龙子湖畔，是一所功能齐全、环境优美，集智能化、生态化为一体的省级园林式单位和绿化模范单位。

学校有本科专业（专业方向）近20个（临床医学、医学检验技术、护理学、医学影像学、药学、预防医学、生物科学、精神医学、食品卫生及营养学、信息管理与信息系统、口腔医学、制药工程、药物分析、医学影像技术、生物技术）；有基础医学、临床医学和护理学3个一级学科硕士学位授权点，临床医学、公共卫生和口腔医学3个硕士专业学位授权点，29个二级学科授权点。学校面向全国18个省市招生，现有普教本专科在校生12000余名，硕士研究生700余名。校本部和直属附属医院共有教职医护工3000余人，其中副高以上专业技术人员655人，教授、副教授326人。

学校有省学术和技术带头人及后备人选17人；省教育厅拔尖人才、省高校中青年学科带头人培养对象15人，省高校中青年骨干教师38人。有全国优秀教师6人，省模范教师3人，省优秀教师8人；全国和省五一劳动奖章获得者3人。享受国务院、省政府特殊津贴的专家52人。

学校有“感染与免疫安徽省重点实验室”、“组织移植安徽省重点实验室” 和 “安徽呼吸系病临床基础省级实验室” 3个省级重点实验室；拥有1个省级工程技术中心，1个省人文社科重点研究基地，1个省级产学研战略联盟，2个省级实验教学示范中心，2个省级人才培养模式创新实验区。公开出版发行《蚌埠医学院学报》、《中华解剖与临床杂志》、《中华全科医学》3种学术刊物。拥有国家心理咨询师职业资格鉴定考试点，公共营养师国家职业技能鉴定站，育婴师、养老护理员国家职业技能鉴定站。

学校有2所直属附属医院。第一附属医院是皖北地区规模最大的综合性医院，是卫生部首批三级甲等医院、国家级爱婴医院、国家临床药理基地。第一附属医院实际开放床位 1925张，年门急诊量超过100万人次，年出院总人数8.2万余人次，年手术总台数3.3万余台。第二附属医院也是一所集医疗、教学、科研、预防、康复为一体的三级综合性医院。医院实际开放床位800张，年门急诊量超过40万人次，年手术总台数6000余台。学校现有11所非直属附属医院，150多家教学医院、实习医院和实习基地，主要分布在北京、上海等10个省市。

学校历来重视学生基础理论和基本技能培养，毕业生以基础理论扎实、动手能力强赢得社会广泛赞誉。2012年、2013年、2014年，蚌埠医学院代表队连续三次问鼎全国高等医学院校大学生临床技能竞赛总决赛，并蝉联二等奖以上奖项。在2013年首届全国医学影像专业大学生实践技能大赛中，蚌埠医学院代表队荣获大赛团体特等奖。

学校积极开展国内外学术交流活动，先后与美、法、德、日、澳等国学术机构、院校建立了协作关系。2008年在亚洲五国招收留学生69人。

建校至今，学校已经培养出包括中国工程院院士刘德培、中国科学院院士段树民在内的各级各类医学专门人才五万余名，为我国的医药卫生事业和经济社会发展做出了重要贡献。