山西中医学院于1982年由国务院批准筹建。1986年学校接收原山西医学院中医大学班，1989年6月正式挂牌成立。1999年6月，学校通过了原国家教委本科教学工作合格评价。2002年开始招收留学生。2007年4月，学校以“良好”的成绩通过了教育部本科教学工作水平评估。2008年2月，学校获得了硕士单位授予权。2013年，获批招收港澳台地区本科生。学校现已成为山西省中医药教育、科研、医疗、文化的中心。

学校办学实力不断壮大，机构设置日趋合理。学校老校区占地262亩，建筑面积13.8万平方米。新校区位于山西省高校园区，占地912亩，规划建筑面积33.31万平方米，预计投资10.5亿元。学校现有资产总值11.1691亿元。图书馆馆藏纸质图书65.5万册、电子图书38万种，引进中外文系列数据库15个，数字资源总量近12TB，是山西省中医药信息中心、山西省高等院校图书馆自动化建设乙级馆。

校本部设有教学单位13个，另有一所办学体制相对独立的专科层次二级学院—山西中医学院推拿职业技术学院。学校设有72个教研室，18个教学实验室。其中，山西省高等学校重点实验室1个，省级医学重点实验室1个，省级基础课示范实验室2个，省级普通高校实验教学示范中心2个。

学校以中医药专业为主体，不断拓展专业领域。现设有本科专业及专业方向18个。其中，国家级第一类特色专业建设点和教育部第一批本科专业综合改革试点专业1个，省级高校特色专业建设项目2个，省级品牌专业3个，省级优秀教学团队2个，省级精品资源共享课11门。2009年以来，学校全面启动了专业建设与教学改革工作，探索“四步”建立中医药人才培养的新模式。2013年，学校在医学类各专业“实验班”基础上组建了傅山学院，实施精英教育培养模式。现有普通全日制硕士研究生282人，本科生6024人，高职在校生1049人，成人在校生2155人。