新疆大学的前身是创办于1924年的新疆俄文法政专门学校。1935年1月改建为新疆学院，1960年10月1日,正式成立新疆大学，1978年被国务院确定为新疆唯一的全国重点大学，1997年被列入国家“211工程”重点建设高校，2000年被确定为国家西部大开发重点建设高校。2000年12月30日，新疆大学与原新疆工学院合并组建新的新疆大学。2004年，学校成为新疆维吾尔自治区人民政府、教育部“区部共建”高校。2012年，学校被列为国家“中西部高校提升综合实力工作”建设高校。